Este paso es un poco más avanzado y no te recomiendo hacerlo sino tienes los conocimientos necesarios. 

¡Importante! Haz una copia de seguridad de la base de datos antes de llevar a cabo cualquier acción.

Para optimizar la base de datos debes acceder a ella desde phpMyAdmin, este acceso lo encontrarás en el CPanel de tu hosting.

Hacer una copia de seguridad

Selecciona tu base de datos y en el menú de arriba ve a la opción Exportar, selecciona la opción rápida y dale a Continuar. 

Optimizando la base de datos